基础医学实验教学中心（后简称“中心”）始建于2007年，为四川省首批省级教学示范中心，由医学形态学实验室、病原生物与免疫学实验室、医学机能学实验室和解剖学实验室等教学实验室及大学生创新实验室、协同育人平台组成。中心建筑面积12,144m²，拥有中国数字人解剖系统、Motic数码显微互动教学系统、泰盟BL-422 I实验教学系统、全自动扫描显微镜、荧光定量PCR等教学及科研设备，总值7,641 万元。

目前有专职实验教师及技术人员共20人，四川省教学名师1人，校级教学名师2人，硕士生导师5人。近年来，本实验室教师共主持和参与国家级、省厅级课题8项，发表SCI论文30余篇。主编、副主编教材5部，参编教材6部，获四川省教育教学成果奖3项，国家专利10余项，累计指导学生开展各级大学生创新创业项目、开放性实验等20余项，指导学生发表论文20余篇，依托基础医学大学生创新创业实践基地，指导学生参加创新创业大赛获得校级奖励110余项，省部级以上奖励35项。